กล้องจุลทรรศน์สามมิติที่ใช้ในการตรวจสอบชิ้นส่วน งานประกอบ และการควบคุมคุณภาพในอุตสาหกรรมการผลิต สามารถสังเกตการณ์แบบสามมิติได้ ใช้สำหรับตรวจสอบการติดตั้งชิ้นส่วนอิเล็กทรอนิกส์ ตรวจสอบพื้นผิวชิ้นส่วนเครื่องจักร ตรวจสอบคุณภาพจุดเชื่อม และตรวจสอบการปนเปื้อนของสิ่งแปลกปลอม เป็นแบบสองตาเป็นหลัก เฉพาะสำหรับการสังเกตการณ์กำลังขยายต่ำประมาณ 10-100 เท่า มีรุ่นที่มีไฟ LED รุ่นรองรับกล้องดิจิทัล และรุ่นแขนเคลื่อนที่เพื่อตอบสนองความต้องการของสถานที่ทำงาน แตกต่างจากกล้องจุลทรรศน์โลหะและกล้องจุลทรรศน์วัดขนาด คือไม่ต้องเตรียมตัวอย่างล่วงหน้าและสามารถสังเกตการณ์โดยตรงในสถานที่ทำงานได้